Флора

Из всех существующих на территории Имерети пещер, с ботанической точки зрения, изучен лишь заповедник и заказник Сатаплия.
Заповедник Сатаплия расположен во влажном субтропическом поясе. Практически 98% территории заповедника покрыто молодым субтропическим лесом, Колхидского типа. На этих территориях доминируют подлесок из буковых –самшитовых, а также грабовых и восточно-грабовых насаждений. Из хвойных представителей здесь можно встретить тис ягодный (тахус баццатта). Здесь описано до 67 видов сосудистых растений, из которых к древесным относится 30 видов, а 37 видов относится к кустарниковым. Из представленных видов 59 относится к лиственным, а 8 видов относится к вечнозеленым.

Практически половина сосудистых растений являются реликтовыми. Среди них кавказский граб, грузинский дуб, восточный бук, каштан и другие.

Из элементов Колхидского леса в заповеднике распространены 8 видов: дуб Гартвиса, имеретинская крушина, рододендрон понтийский, иглица понтийская, бабья ягода (иглица листоплодная, александрийский лавр), клекачка имеретинская, черника кавказская и Колхидский самшит. Из элементов Полтавской флоры, самшит, Колхидский плющ, рододендрон понтийский и другие.

Из луговых растений здесь распространены 482 вида растений.

Виды, внесенные в «Красный список» («Красный перечень»/ «Красную книгу») Грузии

Следует отметить, что в заповеднике Сатаплия распространены редкие и находящиеся на грани исчезновения 9 сосудистых растений, внесенных в «Красный список! («Красный перечень»/ «Красную книгу»)Грузии:ягодный тис ( Taxus baccataL.), Колхидский самшит (BuxuscolchicaPojark.), каштан (Castanea sativa Mill.), имеретинский дуб( QuercusimeretinaStev. ex. Maleev.), Колхидскаяклекачка (StaphyleacolchicaStev.), дзельква (Zelcovacarpinifolia (Pall.) C. Koch.) и другие.

Эндемика и реликтовые

Здесь представлены три представителя кавказской эндемики и один экземпляр грузинской эндемики.

Фауна

В заповеднике Сатаплияраспространены 12 видов млекопитающих, 5 видов рептилий, 4 вида амфибий и 30 разновидностей птиц. Из крупных млекопитающих здесь встречаются шакал, барсук, лесная куница, кавказская белка, европейский заяц и лиса, реже встречаются волки и косули. Прекрасные пейзажи Колхидских лесов наполнены множеством пернатых. Заповедные территории являются владением ласточек, кавказских зябликов, зябликов и соек. На этих территориях частыми гостями являются удоды, перепела и вальдшнепы.

На территории заповедника Сатаплия сохранились следы травоядных и хищных динозавров, обитавших в этих краях во времена древних геологических эпох.

Следует отметить, что эти следы сконцентрированы на достаточно небольшой территории, что указывает на то, что эта местность была местом обитания динозавров. Следы обнаруженных здесь динозавров ученные выделяют в отдельную группу и называют их Сатаплиазаурусами. Срединих: Sataphliazaurus dzotsenidze, Sataphliazaurus tchabukiani; Sataphliazaurus gabunia и другие. Пещеры Имерети являются пристанищем для множества разновидностей летучих мышей, один из которых является редким и находящимся на грани исчезновения. Здесь можно встретить: сравнительно большую колонию малого подковоноса (RhinolophushipposiderosBechtein). Кроме вышеуказанного вида на территории пещер распространены: большой подковонос (Rhinolophus ferrumequinum); остроухая ночница (Myotis oxygnathus Monticelli); Ночницу Наттерера (Myotis nattereri Kuhl), усатая ночница (Myotis mystacinusKuhl.); малая вечерница (Nyctalisleisteri Kuhl); рыжая веченица (Nyctalis noctulaSchreber).

Виды, внесенные в «Красный список» («Красный перечень»/ «Красную книгу») Грузии

По существующим данным на территории заповедника и заказника Сатаплия распространено 8 видов пернатых и один вид летучих мышей: Это длинноухая ночница (Myotis bechsteini Kuhl.). Из птиц следует отметить полевую пустельгу, мохнатого сыча, канюка, полевого канюка или курганника, большого подорлика и других.

Эндемика

Из малых млекопитающих девять видов относятся к местной эндемике. Среди них малоазиатская мышь (Sylvamusmystacinus), кавказская лесная мышь (Sylva emus full vipectus), черная крыса (Rattus rattus) и другие.